# Significance level (between 0 and 1. The default value is 0.05.):
sigLevel = 0.05
################################################################################################################
# Absolute file path or file folder path:
path = D:\Program Files\proguard4.11\proguard4.11\lib\testFile
################################################################################################################
# Do you treat gap as the 5th character or not ? 'yes' (default value) or 'no' (Case insensitive)
indelOption = yes
################################################################################################################
# The sequence type of your file (Case insensitive): 'p' or 'phased' represents Phased Haplotype (default value); 
#                                                    'u' or 'unphased' represents Unphased Haplotype; 
#                                                    'd' or 'diplotype' represents Diplotype.  
dataType = phased
################################################################################################################
# List of outgroups (Multi-outgroups are supported. Multi-outgroups represent different species rather than 
# different individuals of one species), seperated by ' ' or ',' or ';' or '.' (Case insensitive)
outgroupNames = OUTGROUP1;outgroup2;outgroup
################################################################################################################
# List of migrant-detectors, seperated by ' ' or ',' or ';' or '.' (Case insensitive)
migrantDetectors = MD
################################################################################################################
# Output file name (e.g. XXX.txt):
outputFile = MFDMoutput.txt
